Mařinku vonnou raději nepodáváme samostatně, ale přidáváme ji do čajových směsí s jinými bylinkami, protože obsahuje látku, která při dlouhodobém nebo nadměrném užívání způsobuje bolesti hlavy, zvracení, závratě nebo dokonce poškození jater, zástavu dechu a smrt.
Při sběru si nesmíme mařinku vonnou splést se svízelem lesním. Ten poznáme podle toho, že má mnohem tmavší listy, drobnější květy a vůbec nevoní.