Lomikámen zrnatý byl v minulosti nazýván kameníček, lupkámen, mejdlíčka, skalní koření,…
Protože roste na skalách a používá se k rozpouštění močových a ledvinových kamenů, dostlal jméno lomikámen.
Také latinské jméno Saxifraga v překladu znamená skály lámající nebo kameny lámající v lidském těle.