Lípa malolistá je listnatý, až 25 metrů vysoký strom. Světle šedá kůra stromu je v mládí hladká, později ztmavne a podélně popraská. Listy jsou střídavé, řapíkaté, nesouměrně srdčitě okrouhlé a pilovité. Listy jsou na svrchní straně lysé a na spodní straně mají v úžlabí žilek chomáčky žlutě až hnědě zbarvených chloupků. V úžlabí listů vyrůstají dlouze stopkatá květenství s velkým, blanitým listenem a 5 až 15 květy. Plod je kulovitá nažka. Kvete od června do července.